制藥純化水的制備單元由預處理系統以及純化水機組成，其功能在于連續、穩定地將原水凈化使出水水質能夠符合企業內控指標或者藥典要求。而儲存及分配系統由儲存單元、分配單元和用點水管網單元組成，其主要功能是在一定的壓力、流量和溫度下，將制藥用純化水輸送到所需的工藝崗位，并維持水質始終符合藥典要求。應用于：醫療器械、針劑、粉刺針、制藥用水、血液凈化大輸液、生化制品用水、醫用無菌水、口服液用水等。
制藥純水系統主要包含預處理系統、制水系統、存儲與分配系統等；若想確保最終純化水的質量穩定可靠，設計階段非常關鍵，其決定著產出的水質是否能夠符合標準要求。制水系統通常分為：預處理+一級反滲透+二級反滲透；一級反滲透+二級反滲透+EDI；預處理+離子交換法。企業在選擇制水系統時，應從系統的產水水質穩定性和設備經濟性兩個方面來作重點考量。
制藥純水系統降低和防止紅銹現象的措施：
適當降低注射水系統循環溫度，如保持在70~80℃循環。
嚴格控制系統3D死角原則，防止殘留物引起的晶體腐蝕。
保證良好的酸洗鈍化效果并有效生成鈍化膜。
嚴格按照焊接標準操作規程進行焊接。
選擇質量可靠的360°旋轉型噴淋球，防止脫落鐵屑導致的外源性鐵離子引入。
選擇有質量保證的原材料進行系統安裝。對不銹鋼管道管件的材質報告進行系統追溯，保證316L材質的品質和拋光度。
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